É formado por duas regiões: o núcleo (que contém toda carga positiva e praticamente toda massa do átomo) e a eletrosfera (que fica envolta do núcleo e é praticamente vazia e onde se encontram os elétrons). O núcleo do átomo é extremamente pequeno em comparação ao átomo. Rutherford denominou as partículas positivas de prótons. Em 1932 Chadwick descobriu uma partícula não carregada eletricamente e a chamou de nêutron. Os prótons e os nêutrons são encontrados no núcleo, daí são chamados de nucleons. Para identificar um átomo geralmente temos que especificar seu número atômico e seu número de massa. O número atômico é o número de prótons do núcleo.