A Aplicação do Programa Pedagógico Estruturado busca compreender o funcionamento mental e cerebral utilizando de técnicas que incluam atividades de estimulação de funções cerebrais ou de ensino de estratégias de compensação, além disso, busca contemplar as diferentes formas de intervenção, visando o desenvolvimento global. Quando devidamente planejada e adequada, a utilização dessas metodologias pode viabilizar e favorecer o desenvolvimento e aprendizagem do aluno com deficiência e contribuir para seu processo de inclusão no contexto escolar.