A forma como a controladora do HD vê os dados armazenados nos discos magnéticos pode ser bem diferente da forma como vê o sistema operacional. Enquanto a controladora enxerga as trilhas, setores e cilindros e se esforça para localizá-los nos discos magnéticos, usando as marcações servo, o sistema operacional enxerga apenas uma longa lista de endereços, chamados de clusters ou blocos. Quando o sistema precisa de um determinado arquivo, ele não se preocupa em tentar descobrir em qual trilha e setor ele está armazenado. Ele apenas envia o endereço do bloco que deve ser lido e a controladora se encarrega do restante.